علت دقیق مرگ ناگهانی کودکان مشخص نیست ولی این کودکان معمولا از همان ابتدا مشکلات جسمانی نشان می دهند که به این مشکلات اشاره می کنیم : زودرسی و وزن کم به هنگام تولد ، نمرات آپگار ضعیف ، تونوس عضلانی شل ، ضربان قلب و تنفس غیر طبیعی ، بی نظمی های خواب و بیداری ، عفونت های خفیف تنفسی و نارسایی تنفسی .
هم چنین این نظر نیز وجود دارد که ارتباط خواب و تنفس با مرگ ناگهانی کودک به این کودکان اجازه نمی دهد وقتی بقای آنها به خطر افتاد بدنشان پاسخ درست بدهد و از مرگ نجات یابند ؛ کالبد شکافی این کودکان نشان داده است کودکانی که به مرگ ناگهانی از دنیا رفته اند بیشتر از سایر کودکان ناهنجاری هایی را در مراکز کنترل کننده تنفس نشان می دهند .